Las batallas se desarrollarán bajo el conocido «Active Time Battle» de las versiones de IV a IX, con ajustes que lo acercarán a la jugabilidad de títulos más recientes, y el nuevo sistema «nosé nosé», consistente en el apilamiento de hasta tres unidades, jugará un papel determinante:
- Con el aspecto chibi podremos subirnos a hombros de los monstruos más voluminosos de nuestro grupo, y los más pequeños podrán encaramarse sobre nuestra versión «grande».
- Cada «torre» construida cuenta con los poderes y recursos combinados de sus componentes, que actuarán de forma conjunta en un único turno.
- Contaremos con la posibilidad de crear y deshacer grupos durante el combate.
- Las fuerzas enemigas cuentan con las mismas posibilidades.
- Algunos ataques de ambos bandos permiten desmontar grupos rivales.